Apophis, in dessen Diensten als erster Primus Teal'c stand, bevor er sich dem SGC anschloss, wählt sich durch das Gate der Erde und macht sich so selbst neue Feinde. Zu diesem Zeitpunkt ist das Stargate-Programm noch nicht ins Leben gerufen, aber sein Angriff und die Entführung von einer Soldatin bezweckt das schlussendlich.
Mit dieser Aktion, der Entführung von Daniel Jacksons Frau Sha’re und Jack O’Neills Freund Skaara, die beide zu Goa’Uld gemacht werden, lenkt er den Zorn des SG-1 Teams auf sich. Mit Sha’re hat er später ein Kind, Shifu, ein so genanntes Harsesis-Kind, dass das Wissen der Goa’Uld in sich trägt.
Er unternimmt immer wieder Versuche, dem Team und den anderen Erdlingen zu schaden, doch gelingt ihm das eher weniger.
Apophis stirbt aufgrund zahlreicher Verletzungen und durch die Folter eines Feindes, wird aber mit einem Sarkophag wieder zum Leben erweckt. So dient er eine Weile auf Sokars Gefängnisplaneten baut sich schließlich aber wieder eine eigene Flotte und Armee auf.
Während einer Schlacht, in die wiederum das SG-1-Team und auch die Replikatoren verwickelt sind, übernehmen die Replikatoren Apophis Schiff und töten alle Insassen…